Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SRSF5Q13243 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms