Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms