Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CHAF1BQ13112 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CHAF1BQ13112 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHAF1BQ13112 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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