Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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GPS1Q13098 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GPS1Q13098 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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