Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms