Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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LINC00587B1AMM8 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LINC00587B1AMM8 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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