Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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USP35Q9P2H5 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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USP35Q9P2H5 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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USP35Q9P2H5 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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USP35Q9P2H5 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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