Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCG3Q8WXD2 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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