Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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ANKRD42Q8N9B4 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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ANKRD42Q8N9B4 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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ANKRD42Q8N9B4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD42Q8N9B4 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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