Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms