Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
FXNQ16595 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
FXNQ16595 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
FXNQ16595 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms