Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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