Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms