Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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ITGB3BPQ13352 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGB3BPQ13352 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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