Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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