Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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