Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms