Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF3C6Q969F1 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms