Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP5B1Q2VPB7 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms