Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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