Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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