Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
HERC1Q15751 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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HERC1Q15751 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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