Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms