Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms