Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NFIXQ14938 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms