Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL3Q13618 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms