Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXE3Q13461 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXE3Q13461 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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