Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM28Q13263 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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