Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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PTPRMP28827 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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PTPRMP28827 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTPRMP28827 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTPRMP28827 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTPRMP28827 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTPRMP28827 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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PTPRMP28827 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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