Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms