Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP18Q9UMW8 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms