Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CCBE1Q6UXH8 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms