Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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ECM1Q16610 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
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