Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms