Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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CNGB1Q14028 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CNGB1Q14028 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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CNGB1Q14028 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CNGB1Q14028 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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