Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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