Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms