Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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CDH18Q13634 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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CDH18Q13634 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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