Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms