Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP1Q12981 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms