Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms