Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC008739.5-201ENST00000623035 1938 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC01721-201ENST00000457274 2376 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TRHP20396 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 LINC00927-203ENST00000558913 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC022182.3-201ENST00000529239 2167 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 C1QTNF3-AMACR-201ENST00000382079 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 SLAMF7-207ENST00000458602 2449 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 LINC01427-204ENST00000635299 1978 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TRHP20396 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 AGBL4-204ENST00000371839 2947 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 CEACAM7-201ENST00000006724 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 MIR4290HG-201ENST00000426593 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TRHP20396 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 NUDT5-207ENST00000491614 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TRHP20396 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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