Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
HOXD8P13378 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms