Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms