Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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