Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PFDN4Q9NQP4 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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