Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
LRRIQ1Q96JM4 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms