Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CSAG1Q6PB30 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms