Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL4A6Q14031 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms