Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
DDX39BQ13838 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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